2014年10月，国家科技部、原国家卫生计生委和原总后勤部卫生部联合认定首都医科大学附属北京友谊医院为国家消化系统疾病临床医学研究中心（以下简称国家消化中心）。

2015年，国家消化中心担任国家临床医学研究协同创新战略联盟秘书长单位，积极落实“三聚合”和“三对接”的功能定位，协助科技部社发司、生物中心等上级部门，进行一系列调研工作，为政府决策提供多项数据支撑；牵头开展联盟宣传支持平台建设工作，通过科普丛书、公众号等线上线下媒体平台，广泛宣传推广全国50家国家中心的优秀成果。

       中心建立“一体两翼”的组织管理模式，国家消化中心主任为首都医科大学附属北京友谊医院院长张澍田教授，副主任为肝病中心主任贾继东教授、普外科主任张忠涛教授、肝移植科朱志军教授。三个学科四个方向为中心的主体及核心，同时设置综合办公室负责国家消化中心的统筹管理和协调工作，并配套数据库及样本库平台、伦理平台、方法学平台等多个支撑平台，搭建多层次、辐射全国的临床研究协同网络。

国家消化中心是国际最大的综合性消化系统疾病诊疗研究中心之一，首先倡导了消化系统疾病的横向学科联合与纵向序贯诊治的结合；形成消化系癌前疾病和早癌的规范化诊治、终末期肝病序贯诊治及内镜-腔镜联合微创诊治三个特色方向；将消化系统疾病适宜技术推广至海外及全国150余家基层医疗单位，为提高消化疾病临床诊治水平、创新和转化能力、培养高水平专业人才和技术普及做出重要贡献。

消化分中心将“消化内镜术（Endoscopy）”精准进化，首创“消化内镜学（Endoscopology）”新概念，从而完成了从诊疗技术到医学学科的巨大飞跃；2020年消化内镜中心被世界内镜组织WEO评选为“全球最佳内镜中心”（WEO Centers of Excellence，CoE），全球仅20家中心获此殊荣；建立了消化系统疾病研究队列并牵头制定、出版国内首个消化内镜标准化术语专业书籍《消化内镜诊治标准术语集2020》；构建了国产内镜研发、评价与推广的全链条生态体系；基于记忆材料导向的多维智能成像胆胰管镜系统研发、内镜下人工智能早癌识别系统研发、3D图像成像系统研发，革新了“ERCP”等内镜诊治理念；首次完成基于早期结肠癌血浆外泌体miRNA谱的绘制；2021年获批了消化诊疗技术北京市工程研究中心。

肝病分中心提出肝纤维化评价的新标准——“北京标准”，进一步拓展了肝纤维化逆转的定义；牵头建设“中国消除乙肝临床研究平台（CR-HepB）”和“中国遗传代谢性肝病注册网”（CR-GMLD），构建完善少见疑难肝病基因诊断平台；“逆转乙型肝炎肝硬化的临床诊疗新体系及推广应用”获2022年华夏医学科技奖一等奖，“肝纤维化逆转机制、评价体系及应用推广”获北京市科技进步一等奖，“基于弹性检测设备的健康状况分析方法及系统”获第六届北京市发明专利奖二等奖；成立北京市肝病新药临床试验联盟，推动联盟内伦理审查结论互认；从分子、细胞、细胞外基质等多靶点多层次探讨了肝纤维化的逆转机制；牵头或参与制定了20余项国内外行业指南、共识。

普通外科分中心保持全腹腔镜下胃肠道微创外科手术技术、肝胆胰微创外科手术技术、直肠癌经肛全直肠系膜切除技术、减重与代谢外科微创外科手术技术等消化系统疾病微创外科技术创新优势；在“十二五国家科技支撑计划项目”和“十三五科技部重大专项数字诊疗装备研发项目”基础上，实现国产单孔腔镜手术机器人自主研发与转化应用，完成国产单臂构型手术机器人首例人体试验（First-in-Man，FIM），荣获麒麟科学技术奖等多项奖项；并持续引领“大中华减重与代谢手术数据库”“中国TaTME网络登记协作研究系统”等高水平、高质量全国多中心临床研究及数据平台建设。

肝移植科国际首创交叉辅助多米诺肝移植新术式，优化儿童活体供肝手术，缓解出生缺陷儿童供肝短缺；国内率先开展遗传代谢性肝病的系列研究，扩大肝移植在出生缺陷儿童的应用，创多项第一；建立了完整的儿童肝移植管理体系，创造了国内胆道闭锁婴幼儿肝移植最长生存纪录，胆道闭锁儿童肝移植后5年生存率居全国第一；国际上率先提出儿童肝移植联合解剖性部分脾切除预防术后顽固性脾亢的方法；建立了儿童肝移植术后血管并发症的综合防治策略，使门静脉狭窄的发生率从9.8%降至2.2%；建立了麻醉管理、术后感染防治、远期并发症诊治的策略，并制定技术规范和专家共识。

国家消化中心成立以来，共获批国家级课题105项，其中国家重点研发计划10项、国家科技重大专项6项、国家自然科学基金79项；共发表文章1273篇，其中SCI 626篇，IF=""2599.31分；牵头编写/改写国内外指南、行业规范89项，出版专著15部；共获得国家授权发明专利25项。基于以上成果，于2023年获批科技部“消化健康”全国重点实验室。

国家消化中心远期目标：①协同开展多中心、高质量的消化系统疾病，特别是消化系癌前疾病、早癌的规范化诊治、终末期肝病序贯诊治及内镜-腔镜联合微创诊治的临床研究；②制定基于循证医学依据的消化系统疾病诊疗指南、规范和普及推广，提高诊疗水平；③培养全国消化系统疾病领军人才和学术带头人，以及各级医疗单位消化人才。立足中国，面向世界，在消化系统疾病临床医学研究中发挥创新、引领、规范、辐射和带动作用！